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华中农业大学自然遗传学:构象染色体捕获新技
作者:365bet比分网  更新时间:2019-10-09 05:57:36
Hi-C技术是3D基因组学的主要研究方法,但具有实验成本高,数据噪声大,实验过程复杂的缺点。
华中农业大学的研究人员最近发表了一篇题为《捕获染色体构象的高效,低成本的消化结扎方法》的文章。背景数据噪声:高质量,低成本访问Hi-C数据。
研究结果发表在4月26日的NatureGenetics中。本文的作者是华中农业大学“古田学者特聘教授”曹瑜教授和李国良教授。第一作者是林达和洪平。
在同一时期,NatureGenetics还发表了一篇评论文章,指出该文章“引领了一种重要的双连接策略,该策略在执行早期质量控制的同时消除了噪音”。
“ Hi-C技术是3D基因组学的主要研究方法。新的DLOHi-C染色体构象捕获技术使用同步酶消化方法在核酸内切酶切口的末端连接DNA接头,最后传统上,该酶用MmeI核酸内切酶消化,可恢复固定大小并相互作用的DNA片段,从而显着降低背景数据噪音并获得比Hi-C高品质的数据。
DLOHi-C技术还可以用于检测染色体易位。
DLOHi-C技术显着降低了全基因组染色体构象捕获实验的成本,简化了实验步骤,极大地提高了实验成功率,支持并解决了基因组组装的问题组件功能包括疾病易感基因座,检测染色体结构变异很重要。
这种DLOHi-C技术为分析3D基因组结构提供了一种新的有效方法。
理解作者概况的最流行的单细胞转录组序列:曹宇,男子。
华中农业大学教授,博士生导师,基础兽医学主任,生物医学中心副主任。
《科学报告》杂志社论委员会农业微生物学的主要国家研究人员。
2008年,他在荷兰的分子生命科学中心完成了博士学位论文,并获得了2008年国家学生奖。
2008年至2010年在加利福尼亚州桑福德伯纳姆医学院进行博士后研究。
2010年至2012年在冷泉港实验室进行博士后研究。
要联系作者或第一作者并在JACC,CurrentBiology,NAR,JBC,Oncotarget,ScientificReprot和其他出版物上发表许多文章,请申请一系列专利。
致力于神经病学和神经科学的跨学科研究。
3D基因组测序,单个细胞测序,TRAP,甲基化测序和其他先进的高性能测序技术,以及两光子体内图像,超分辨率图像,CRISPR / Cas基因编辑,蛋白质相互作用,核酸等。现代分子生物学技术着眼于三个方向:1。
研究关于病原体入侵和免疫反应的神经系统知觉和调节。
2)
这种转化利用嗜神经病毒来检查大脑的神经回路,尤其是那些参与调节免疫系统的神经回路。
病原体与宿主细胞相互作用,以研究宿主免疫性结核分枝杆菌寄生,复发和逃逸的分子机制。
原标题:捕获消化-连接-Hi-Cisanefficiency和染色体高阶结构的经济有效方法

 
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